規模化養殖場糞水處理量大且集中，其中COD、TP等污染物含量高且嚴重超標。如果直接廣泛地用于灌溉用地，土地自身的自凈能力會破壞土壤原有的基本功能，導致土壤孔隙的堵塞，影響土壤質量，造成土壤環境的惡化。污水中有大量的病原菌和寄生蟲卵，不進行無害化處理就會污染環境，環境污染反而導致家畜傳染病和寄生蟲的蔓延和發展也是影響家畜生產水平的直接原因。